Kreuzfahrtschiffe können in der Bucht von Samaná auf See ankern. Besucher werden mit einem Boot zu einem der beiden Landungsstege der Stadt gebracht, von beiden kann man bequem zu Fuß die wichtigsten Einkaufsbereiche, Restaurants und Sehenswürdigkeiten der Stadt erreichen. Manche Schiffe legen direkt in Cayo Levantado an, eine kleine Insel in der Bucht von Samaná, Besucher werden von dort zu den öffentlichen Docks der Insel gebracht. www.cruisesamana.com/
Der Yachthafen von Puerto Bahía bietet alle Annehmlichkeiten, die man in einem modernen Hafen erwarten kann. Er liegt am nördlichen Ufer der Bucht von Samaná und wartet zusätzlich mit sehr guten Restaurants, einem Hotel und einer Ferienanlage auf.